全市轄六鎮(西林吉鎮、圖強鎮、阿木爾鎮、興安鎮、北極鎮、古蓮鎮)，西林吉鎮是漠河市委、市政府(西林吉林業(yè)局)所在地，西林吉鎮設4個(gè)社區，1個(gè)村委會(huì )；圖強鎮設4個(gè)居民委員會(huì )；阿木爾鎮設4個(gè)居民委員會(huì )；興安鎮1個(gè)社區，3個(gè)村民委員會(huì )和1個(gè)居民委員會(huì )；北極鎮1個(gè)社區，3個(gè)村民委員會(huì )和1個(gè)居民委員會(huì )。